High Abundances and Expression Levels of Atypical, Non-Denitrifier N2O Reductases Drive Strong Microbial N2O Consumption Rates in a Minimally Impacted Mangrove Stand  

在受干擾較小的紅樹林中，非典型非反硝化菌N2O還原酶的高豐度和表達(dá)水平驅(qū)動(dòng)強(qiáng)烈的微生物N2O消耗速率  

來源：Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, 129, e2023JG007805  

《地球物理研究雜志：生物地球科學(xué)》第129卷，文章編號(hào)e2023JG007805  

 

摘要內(nèi)容  

 

摘要研究了伯爾慕達(dá)紅樹林沉積物中微生物對(duì)N2O的消耗能力及其在短期營(yíng)養(yǎng)富集下的穩(wěn)定性。發(fā)現(xiàn)紅樹林沉積物在自然和適度富營(yíng)養(yǎng)條件下均為N2O的凈吸收區(qū)（-0.22至-0.30 μmol N2O m?2 d?1），表明其N2O消耗能力超過硝化和反硝化產(chǎn)生的潛力。分子數(shù)據(jù)顯示，紅樹林中非典型反硝化菌的nosZII基因豐度和表達(dá)水平顯著高于產(chǎn)生N2O的NESAP（東北亞北極太平洋）大陸邊緣沉積物。NESAP沉積物的N2O凈排放與典型反硝化菌nosZI基因的高表達(dá)相關(guān)，而紅樹林中nosZII主導(dǎo)的微生物群落作為低氮系統(tǒng)的N2O清除者發(fā)揮關(guān)鍵作用。  

 

研究目的  

 

探究海洋沉積物中微生物群落動(dòng)態(tài)與N2O循環(huán)的關(guān)系，比較低氮紅樹林與高氮大陸邊緣沉積物的N2O代謝差異，闡明非典型nosZII基因在調(diào)控N2O消耗中的作用。  

 

研究思路  

 

選取伯爾慕達(dá)紅樹林（低氮環(huán)境）和NESAP大陸邊緣（高氮環(huán)境）沉積物作為對(duì)比模型。  

 

使用丹麥Unisense微電極測(cè)量孔隙水N2O和O2的垂直分布（圖2、圖3、圖4），結(jié)合PROFILE模型計(jì)算N2O通量和產(chǎn)消速率。  

 

 

 

 

通過qPCR定量nosZI和nosZII基因及轉(zhuǎn)錄本的豐度（圖4、圖5），高通量測(cè)序分析微生物群落結(jié)構(gòu)（圖5）。  

 

 

對(duì)比兩環(huán)境中基因表達(dá)、群落組成與N2O通量的關(guān)聯(lián)。  

測(cè)量的數(shù)據(jù)及研究意義  

 

N2O和O2微剖面數(shù)據(jù)（圖2、圖3、4）：揭示紅樹林沉積物中N2O濃度隨深度遞減，且所有處理下均表現(xiàn)為凈吸收；NESAP沉積物因高硝酸鹽和低氧條件產(chǎn)生N2O凈排放。  

 

意義：驗(yàn)證低氮環(huán)境中N2O的凈消耗能力，明確產(chǎn)消速率的空間分布，支持微生物代謝驅(qū)動(dòng)的通量差異。  

 

nosZI/nosZII基因豐度和表達(dá)數(shù)據(jù)（圖4、圖5）：紅樹林中nosZII基因占比91.8%，轉(zhuǎn)錄本占比84.8%；NESAP中nosZI表達(dá)更高（40.5%）。  

 

 

意義：揭示非典型nosZII基因在低氮系統(tǒng)中的主導(dǎo)地位及其作為N2O清除者的功能，解釋環(huán)境氮水平對(duì)微生物代謝途徑的選擇壓力。  

 

微生物群落結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)（圖5）：紅樹林以Cytophagales、Thiotrichales等菌群為主，與硫循環(huán)和有機(jī)質(zhì)降解相關(guān)；NESAP以硝化菌（如Nitrosopumilales）和典型反硝化菌為主。  

 

 

意義：關(guān)聯(lián)群落功能組成與N2O代謝途徑，闡明不同環(huán)境下的氮循環(huán)策略差異。  

 

結(jié)論  

 

低氮紅樹林沉積物是N2O的凈匯，其消耗能力由非典型nosZII基因主導(dǎo)的微生物驅(qū)動(dòng)，且在適度營(yíng)養(yǎng)富集下保持穩(wěn)定。  

 

高氮大陸邊緣沉積物（NESAP）中典型nosZI基因的高表達(dá)導(dǎo)致N2O凈排放，反硝化是主要來源。  

 

非典型nosZII微生物在低氮系統(tǒng)中作為N2O清除者的生態(tài)功能顯著，為保護(hù)沿海濕地減緩溫室氣體排放提供依據(jù)。  

 

Unisense電極數(shù)據(jù)的詳細(xì)研究意義  

 

使用丹麥Unisense微電極的高分辨率測(cè)量（空間分辨率500 μm）實(shí)現(xiàn)了以下突破：  

精準(zhǔn)定位N2O產(chǎn)消熱點(diǎn)：通過孔隙水剖面（圖2），發(fā)現(xiàn)紅樹林沉積物表層0-2 mm存在微弱N2O生產(chǎn)，但整體以深層（>2 mm）的強(qiáng)烈消耗為主，揭示產(chǎn)消過程的垂直分異。  

 

量化通量與模型驗(yàn)證：結(jié)合PROFILE模型，計(jì)算N2O通量（圖3）和產(chǎn)消速率，證明紅樹林的凈吸收（-0.22至-0.30 μmol m?2 d?1）與nosZII活性直接相關(guān)。  

 

揭示環(huán)境調(diào)控機(jī)制：O2滲透深度（1.2-2.8 mm）與N2O消耗區(qū)的重合表明低氧條件促進(jìn)N2O還原，驗(yàn)證了氧梯度對(duì)微生物代謝的調(diào)控作用。  

 

跨系統(tǒng)對(duì)比：與NESAP沉積物的對(duì)比，突顯氧和氮供給差異對(duì)N2O代謝途徑（產(chǎn)/消）的選擇性影響，為全球沉積物N2O模型提供關(guān)鍵參數(shù)。